Fiocruz: Ômicron representa 99% dos genomas sequenciados em fevereiro

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A variante Ômicron correspondeu a mais de 99,7% dos genomas sequenciados pela Rede Genômica Fiocruz em fevereiro, contra 95,9% em janeiro e 39,4% em dezembro. A atualização dos resultados da vigilância sobre as linhagens e variantes do vírus Sars-2 no Brasil foi divulgada hoje (11) pela Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), com dados referentes ao período de 11 de fevereiro de 202.

Nas três semanas, o Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), no Rio de Janeiro, e os laboratórios integrantes da Rede Genômica Fiocruz nos estados do Amazonas, da Bahia, do Ceará, de Minas Gerais e de Pernambuco produzindo 2.971 genomas. Junto com as unidades do Piauí e do Paraná, os centros de monitoramento atendem aos 26 estados brasileiros e ao Distrito Federal.

Segundo o documento, como as primeiras amostras do Brasil, foram de 2 casos alterados já no fim de novembro221. Em janeiro deste ano, completamente o cenário epidemiológico no país. Atualmente a sigla Ômicron é classificada em mais de 40 linhas, iniciadas pela BA. No Brasil, foram identificados três linhagens: BA.1 (13.072 genomas), BA.1.1 (2.193 genomas) e BA.2 (21 genomas). A circulação da BA.2 de fevereiro, planejada no país no início de, é considerada baixa. O Laboratório de Referência Nacional também sequenciou os genomas de primeira e segunda amostra de dez casos de reinfecção relacionados à BA.1.

Neste relatório, a mediana do intervalo entre a coleta da amostra e o depósito do genoma no Gisaid foi de 59 unidades, com diferenças significativas entre as federativas. Os meses seguintes, entretanto, que há uma forte tendência de diminuição esse intervalo porque, nos últimos, a mediana ficou abaixo de 31 dias. Desde o início de suas atividades, a Rede Genômica Fiocruz já produziu 560 relatórios, totalizando 36.476 genomas sequenciais.

Como informações coletadas de pesquisadores da rede por meio de parceria e colaboração com os laboratórios de departamentos de Saúde Pública (Lacen), da Coordenação-Geral de Laboratórios do Ministério da Saúde, de Laboratórios de Assistência Diagnóstica da Fiocruz e outras instituições. O acesso à base de dados EpiCoV da plataforma internacional de vigilância genômica de novo coronavírus e Influenza Gisaid também auxilia o trabalho de monitoramento da Rede.

Testes

Em janeiro deste ano, o local da Rede Genômica Fiocruz passou a disponibilizar sobre testes RT-PCR capazes de inferir a presença de variantes de disfunções, como Gama, Delta ou Ômicron. Esses exames estão sendo realizados pelos Lacens e por laboratórios de Assistência Diagnóstica da Fiocruz.

O monitoramento apresentado grau de concordância com os dados de sequenciamento, sugerindo taxa de circulação superior a 99% do mês de janeiro. Segundo pesquisador da Fiocruz, a vantagem dessa abordagem é a celeridade de retorno de resultados sem necessidade de sequenciamento das amostras. Além disso, há possibilidade de tal tipo de exame ser descentralizado e executado em diversos outros centros do país.

De novembro de 2021 a fevereiro de 2022, foram realizados 12.187 testes em 19 unidades federativas (Acre, Amapá, Amazonas, Bahia, Ceará, Distrito Federal, Mato Grosso do Sul, Pará, Paraíba, Piauí, Rio de Janeiro, Rio Grande do Norte , Rio Grande do Sul, Rondônia, Roraima, Santa Catarina, São Paulo, Sergipe e Tocantins), informou a Fiocruz.


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